Близьке майбутнє, 2032 рік. Техніка досягла небаченого прогресу, люди ділять світ з кіборгами та роботами. Бато - детектив відділу поліції по боротьбі з тероризмом. Він - живий кіборг, оснащений штучними руками, ногами та іншими частинами тіла. Залишився лише його колишній мозок та пам'ять про неї, про Мотоко Кусанагі.
Разом із напарником Тогусою Бато розслідує серію вбивств роботами своїх власників, причому всі роботи відносяться до експериментальної моделі секс-андроїдів фірми Locus Solus. Компанія воліла б зам'яти справу, відкликавши роботів з ринку та домовившись із родичами загиблих. Але Бато і Тогуса - не з тих, з ким можна укласти полюбовну угоду.