Давним-давно, коли піраміди були ще молоді, правителі Єгипту забавлялися тим, що влаштовували між собою магічні поєдинки, які отримали назву «Ігри тіней». Це призвело до звільнення величезної темної енергії, здатної знищити весь світ. Тоді могутній фараон заточив цю силу всередині таємничих «Тисячолітніх артефактів» ціною свого життя і шести жерців. Минуло 3000 років. Весь світ захоплений «Duel Monsters», картковою грою з використанням комп'ютерних технологій, аналог «Ігор тіней». Школяр Югі Муто є кращим гравцем, але мало хто знає його таємницю. Він зумів зібрати «Тисячолітню головоломку» — давньоєгипетський артефакт, який колись знайшов в експедиції його дідусь...